Hola Ines! El vehículo de matrícula española debe ser entregado en un centro de tratamiento autorizado portugués, y deben entregarte el certificado de destrucción del vehículo. Es importante que conserves la documentación original del vehículo. Después, el trámite de baja en la DGT ha de realizarse presencialmente, aunque no es necesario que esté presente necesariamente el heredero, sino que puedes delegar la gestión en una tercera persona.
Me parece que telemáticamente no se puede realizar la baja, y la DGT tampoco tiene atención telefónica, así que creo que tal vez la opción más eficaz sea subcontratar el servicio a alguna empresa española que te recepcione la documentación y haga el trámite por ti.
Sobre la documentación, además del certificado de destrucción del desguace portugués...
Fotocopia del DNI del titular del vehículo y DNI en vigor de uno de los herederos.
Ficha técnica del vehículo.
Permiso de circulación del vehículo.
Modelo de «Declaración responsable para la solicitud de baja definitiva de un vehículo por fallecimiento de su titular». , firmado por el heredero que estará presente en la recogida del vehículo con grúa. (Nota, al tratarse este de un documento oficial, deberán dejar en blanco los datos del Centro Autorizado de Tratamiento Medioambiental para que sean rellenados por el centro correspondiente)
Si la persona que estará presente en la retirada no fuese el heredero designado en el documento de “Declaración Responsable», se ha de presentar la fotocopia del DNI en vigor por ambas caras de la persona autorizada y el Modelo de Autorización firmado por ambos.
Fotocopia del Certificado de defunción del titular del vehículo.
Link sobre baja en la DGT:
https://sede.dgt.gob.es/es/vehiculos/alt...ndex.shtml
Link sobre documentación necesaria:
¡Suerte!